70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3421 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3421  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.864452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  58.67 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4988  transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4481  transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  35.23 
 
 		 900 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1473  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  31.51 
 
 		 992 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 562 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  29.09 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  31.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  31.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  42.59 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0764  response regulator  30 
 
 		 219 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0758025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  35.71 
 
 		 214 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4680  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141979  normal  0.0546255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 223 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 539 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2536  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  26.92 
 
 		 216 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 237 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.7 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  29.23 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  40.98 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  31.15 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  36.07 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  31.15 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  30.56 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 554 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0115  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  39.29 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 213 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 123 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1733  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 210 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>