78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5791 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 333 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  39.82 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  39.88 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  35.47 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  35.22 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  33.84 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  32.01 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  31.12 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  32.07 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  27.19 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.36 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  29.88 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  33.53 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  35.67 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 219 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  24.62 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  23.36 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 251 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 188 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  32.26 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 127 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  19.71 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 221 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  27.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  25.78 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  35.38 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  46.15 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.55 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.98 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 233 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  39.13 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 123 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  27.51 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 208 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1040  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 216 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 112 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>