105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1856 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 354 aa  702    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  86.4 
 
 		 354 aa  588  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  74 
 
 		 350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  62.11 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  30.14 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  29.62 
 
 		 373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  29.83 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  29.95 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  30.06 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.8 
 
 		 742 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  26.82 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  25.76 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  24.77 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  27.63 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  25.11 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  42.35 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.62 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  26.99 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  22.34 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  40.82 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  24.56 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  31.21 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  24.45 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  21.47 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  30.68 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  23.88 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  23.88 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  27.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  35.58 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  38.81 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  23.44 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.87 
 
 		 261 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 267 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 239 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  20.55 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  20.55 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  21.79 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  20.13 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  34.09 
 
 		 119 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  21.15 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  19.86 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  28.44 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  36.92 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  21.15 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  19.86 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  19.86 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  21.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 248 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  25.84 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  33.33 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  26.62 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 261 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  24.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  25.22 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  24.44 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.39 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.23 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  26.39 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>