129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1382 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  43.12 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  41.85 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  41.05 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  31 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  34.13 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  33.73 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  31.61 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  33.14 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  29.97 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  30.72 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  30.47 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.94 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  35.76 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.42 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  27.57 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  30.82 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  29.74 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 118 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  32.77 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5403  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 206 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  34.92 
 
 		 210 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1771  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  34.38 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.11 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  26.29 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  37.88 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  38.81 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.88 
 
 		 901 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 544 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>