44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1464 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 326 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  42.38 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  38.23 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  37.05 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  36.2 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  33.86 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  33.23 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  29.97 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  31.12 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  29.45 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.17 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.72 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  50 
 
 		 149 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  25.94 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  60.42 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  23.55 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  30.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.04 
 
 		 1085 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 112 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 471 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.74 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>