101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2745 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 270 aa  543  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  53.38 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  27.9 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  26.9 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  26.1 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  23.33 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  25.73 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  29.12 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  27.73 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.35 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  25.15 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  30.24 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  26.77 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.98 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  26.2 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  23.57 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  21.43 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  25.18 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  26.18 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  26.92 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  24.47 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  39.08 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  24.68 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  26.27 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  26.72 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  27.45 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  27.57 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.13 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  34.74 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 340 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  31.07 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  49.06 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  26 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  42.11 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  32.14 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  37.35 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 742 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  36.99 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  30.65 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  25.44 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>