80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0152 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  27.2 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  26.97 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.9 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  39.33 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  24.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  32.31 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  30.61 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  26.62 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  30.1 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  28.83 
 
 		 386 aa  52  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  32.76 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  24.43 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 742 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  27.66 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  34.62 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  34.38 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  27.78 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  37.31 
 
 		 223 aa  45.4  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  36.51 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  22.61 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  25.41 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  22.61 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  29.07 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.4 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 357 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 252 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 278 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 272 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>