56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1810 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  61.76 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  66.95 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  58.82 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  25.42 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.51 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  25.84 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 373 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  20.16 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  26.03 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  26.45 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  23.15 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  25.95 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  22.71 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  26.97 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  26.87 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  21.79 
 
 		 742 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  24.83 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  31.48 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  52.5 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  25.35 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.16 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  35.53 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  30.99 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.16 
 
 		 278 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  27.34 
 
 		 276 aa  42  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 273 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 345 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  24.16 
 
 		 278 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  18.75 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>