95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0750 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  56.67 
 
 
272 aa  299  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 
279 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.35 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 
263 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 
263 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 
249 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  38.01 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  36.55 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  33.7 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  27.92 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.48 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4807  hypothetical protein  28.67 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  31.21 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  25.28 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1804  hypothetical protein  26.83 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3823  hypothetical protein  30.5 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.829852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2318  hypothetical protein  28.47 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1957  hypothetical protein  29.17 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  39.45 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  29.3 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  31.21 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2170  hypothetical protein  27.59 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  26.38 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  32.41 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  45.74 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  26.15 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.86 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  29.94 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  31.98 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  31.37 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  29.38 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  32.99 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  28.03 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  30.12 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.31 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  27.56 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  34.62 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 
350 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  35.58 
 
 
354 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  25.85 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
742 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26.39 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  28.87 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  25.69 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  35.58 
 
 
354 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1370  hypothetical protein  24.16 
 
 
420 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  25.69 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 
357 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  32.69 
 
 
350 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.15 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  36.99 
 
 
119 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  28.14 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  31.51 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  26.4 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  25.41 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  24.2 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  33.9 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  23.02 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  25.81 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  23.12 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.44 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.12 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.46 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0986  hypothetical protein  23.44 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1019  hypothetical protein  23.44 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.46 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  22.93 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.46 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>