92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1683 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  28.84 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  34.31 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  29.88 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.92 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  30.06 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  28.81 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  42.72 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  27.57 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  34.27 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  27.53 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  31.29 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  35.79 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  40.54 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  38.24 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.14 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  22.22 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  37.97 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  28.78 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  28.87 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  28.87 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  28.02 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.87 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  24.4 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  38.27 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 742 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.78 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 357 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 357 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  22.45 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  25.42 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  38.71 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  26.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  27 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  25.57 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  23.36 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  27 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  24.89 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 239 aa  42  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>