103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1897 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  38.8 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  38.52 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  37.69 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  30.92 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  31.78 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  35.88 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  36.54 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  33.71 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  30.06 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  30.94 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  27.27 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4807  hypothetical protein  27.63 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  28.37 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 742 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  23.31 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  30.99 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  27.56 
 
 		 277 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2170  hypothetical protein  28.23 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  28.9 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  30.86 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.24 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  30.63 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1957  hypothetical protein  31.25 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  28.12 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  22.62 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.96 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  23.47 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1370  hypothetical protein  29.58 
 
 		 420 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3823  hypothetical protein  31.87 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.829852  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  32.1 
 
 		 119 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2318  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  21.69 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  21.69 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  22.29 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.69 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  20.63 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26.26 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1804  hypothetical protein  26.35 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  21.62 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  25.18 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  21.16 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  27.85 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  41.07 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  41.07 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  41.07 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  20.55 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  25.25 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 352 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  25.77 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  20.55 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  20.55 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  20.55 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  25.25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  20.55 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 357 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  25.61 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  30.49 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  20.55 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  24.75 
 
 		 386 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>