71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0988 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  100 
 
 		 262 aa  546  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  27.49 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  31.02 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  27.31 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  27.22 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  38.78 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  32.52 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  37.11 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  33.33 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.83 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.81 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  46.27 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  28.48 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  28.48 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27.81 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  25.34 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  24.42 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  34.85 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  27.89 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  29.49 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  27.15 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  23.84 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.66 
 
 		 742 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.63 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  41.07 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.06 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 373 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  25.27 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26.76 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  28.72 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  22.43 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  31.96 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.78 
 
 		 357 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>