53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1399 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  47.81 
 
 		 248 aa  244  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  25.63 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  26.16 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  25.42 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  25.94 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  26.97 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.68 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  32.94 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  27.18 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  34 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  28.75 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  27.15 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  25.77 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  30.25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  30.67 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.91 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  24.18 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  47.83 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  33.8 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  28.95 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1666  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  35.59 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  18.88 
 
 		 258 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  27.87 
 
 		 277 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  22.37 
 
 		 254 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  19.75 
 
 		 262 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 249 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>