78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2039 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  34.94 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  33.83 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  32.41 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  29.09 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.92 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  28.3 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  28.74 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  33.85 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  32.09 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  26.47 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.42 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  26.94 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  26.47 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  25.63 
 
 		 252 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  25.63 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  25.63 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  25.9 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  25.63 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  25.63 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  29.64 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  22.56 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  39.8 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  27.39 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.63 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  36.54 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  24.45 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  30 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.61 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  44.64 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.29 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  25.2 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  45.45 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 		 357 aa  45.8  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  43.4 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  22.43 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  23.57 
 
 		 350 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>