46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3250 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  44.93 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  38.4 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  38.26 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.04 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  28.57 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  25.11 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  30.99 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  20.85 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  25.97 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  30.46 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  29.37 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  22.09 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  22.81 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  21.89 
 
 		 352 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  23.11 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  23.11 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  24.69 
 
 		 373 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  22.59 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  20.71 
 
 		 356 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.38 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  30.67 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  24.67 
 
 		 354 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  23.68 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>