70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0543 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 373 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  51.3 
 
 		 352 aa  335  9e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  54.57 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  51.91 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  47.88 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  42.27 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  35.49 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 350 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  109  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 742 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  26.68 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  26.63 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.05 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  25.07 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  25.31 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.86 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  28.02 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.87 
 
 		 257 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 263 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 261 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  25.93 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.23 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  23.23 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 		 263 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  24.69 
 
 		 234 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 255 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  27.67 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  22.58 
 
 		 261 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.65 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  22.16 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  25.31 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 344 aa  46.2  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  27.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.62 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 250 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 263 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>