58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0131 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 356 aa  719    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  48.43 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  47.88 
 
 		 373 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  48.16 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  48.32 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  38.94 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  33.24 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.61 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.2 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  25.97 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 		 742 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  27.83 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.42 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.42 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.91 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  24.21 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  26.76 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  21.57 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  35.59 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  28.97 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  30.43 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  20.71 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.29 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  24.43 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  21.69 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  21.69 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 146 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  24.18 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  31.11 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  21.69 
 
 		 278 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.61 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  22.38 
 
 		 261 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  22.38 
 
 		 261 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 277 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>