34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1008 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  58.82 
 
 		 239 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  62.61 
 
 		 239 aa  278  6e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  55.04 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  26.25 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  24.75 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  37.27 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  23.65 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  24.86 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 352 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  22.36 
 
 		 357 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 		 354 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  23.55 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.86 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  22.94 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  28.1 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  22.16 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  24.74 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  18.95 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  24.62 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  22.49 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  20.26 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2669  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  30.15 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  24.53 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  21.94 
 
 		 250 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>