49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2233 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  47.06 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  26.94 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  26.86 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  27.13 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  23.31 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  25.88 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 353 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  23.53 
 
 		 354 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  23.37 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  23.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  25.74 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  45.61 
 
 		 512 aa  45.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.68 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  36.51 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.92 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  23.53 
 
 		 119 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  24.19 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 352 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  30.14 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  27.55 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  24.57 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  29.59 
 
 		 264 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  22.55 
 
 		 350 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>