73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0208 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 352 aa  714    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  51.3 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  48.43 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  47.86 
 
 		 352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  46.09 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  38.19 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  35.36 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  33.62 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  35.5 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  31.62 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  26.8 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 742 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  26.65 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  31.41 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30.99 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.14 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  24.58 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.58 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.58 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.58 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  28.66 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  24.56 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.11 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  24.04 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 261 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  24.06 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.29 
 
 		 261 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  25.29 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.58 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  21.89 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  36.84 
 
 		 264 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.24 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  27.71 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  28.66 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  29.14 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  24.71 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  27.65 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.14 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.75 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  29.11 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  27.37 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  24.89 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  35.48 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  26.19 
 
 		 288 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  28.03 
 
 		 250 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 248 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>