35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4098 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 351 aa  722    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  35.49 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  35.36 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  35.23 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  35.46 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  30.75 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  26.69 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.32 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.9 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  27.64 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  22.68 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.98 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  23.14 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  22.62 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  22.01 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  28.1 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  26.7 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  23.23 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  23.03 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  24.83 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  23.3 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  24.86 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  31.67 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  24.28 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  24.28 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>