77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4089 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 742 aa  1507    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2662  hypothetical protein  31.54 
 
 		 372 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.87 
 
 		 350 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 354 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  25.97 
 
 		 350 aa  101  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  26.81 
 
 		 354 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 358 aa  92  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3326  hypothetical protein  22.73 
 
 		 370 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  26.78 
 
 		 357 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 373 aa  87.8  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  25.9 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 352 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  22.68 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  23.31 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 279 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  28.19 
 
 		 250 aa  62  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.79 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.65 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  24.38 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.55 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  23.55 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  23.14 
 
 		 261 aa  57.4  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.06 
 
 		 263 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 250 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  23.62 
 
 		 262 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  22.82 
 
 		 261 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  39.44 
 
 		 267 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.55 
 
 		 261 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 258 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  43.55 
 
 		 262 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 270 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.67 
 
 		 255 aa  54.7  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  26.63 
 
 		 263 aa  54.3  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  26.05 
 
 		 272 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  38.03 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 277 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  23.94 
 
 		 249 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.4 
 
 		 345 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 273 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 248 aa  52  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 288 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 		 255 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 		 262 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  26.72 
 
 		 252 aa  50.8  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  20.52 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3222  hypothetical protein  22.98 
 
 		 344 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 249 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  22.86 
 
 		 263 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 		 281 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  31.94 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  24.14 
 
 		 271 aa  47.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  27.66 
 
 		 262 aa  47.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 		 267 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  21.18 
 
 		 278 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  25.77 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 268 aa  44.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  21.79 
 
 		 239 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 261 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  25.49 
 
 		 252 aa  44.3  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  24.44 
 
 		 264 aa  43.9  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>