98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2263 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 358 aa  726    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  56.42 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  42.06 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  38.83 
 
 		 373 aa  245  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.53 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  25.76 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  29.36 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  25.9 
 
 		 351 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 742 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  26.46 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  24.37 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  23.4 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  24.09 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  24.05 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.63 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.21 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.88 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.21 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  23.31 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  22.88 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  22.88 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  22.88 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.04 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.66 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.22 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  22.28 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  27.46 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  29.44 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  44.58 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  25.14 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  26.87 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  23.12 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.32 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  35.37 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 		 255 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 258 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  24.22 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  33.75 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  26.62 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  28.86 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 261 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  25.43 
 
 		 261 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  47.27 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  35.14 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 250 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  42.62 
 
 		 254 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  24.08 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  24.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  39.06 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  24.06 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  32.47 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  20.59 
 
 		 276 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  29.63 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  23.68 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  23.68 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  24.71 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  24.48 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>