107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3670 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  31.39 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  29.43 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  28.73 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  27.24 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  39.5 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  29.39 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  24.25 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  26.54 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  23.33 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  27.75 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.14 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  34.74 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  27.17 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  27.46 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  23.67 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.24 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 		 742 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  27.71 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.19 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  29.19 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.74 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  35.53 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 350 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  23.95 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  27.41 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  27.41 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  23.78 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  25.52 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  20.52 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  21.76 
 
 		 386 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  35.82 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  36.78 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.62 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  28.79 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  35.44 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  28.65 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  20.57 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  33.85 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 		 354 aa  46.2  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  33.82 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  28.49 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  23.39 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  28.43 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 352 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>