18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4460 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1568  transcriptional regulator, TrmB  26.56 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4640  transcriptional regulator, TrmB  24.31 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  30.39 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  22.49 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  34.07 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 358 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  21.26 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>