93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0459 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  31.33 
 
 
262 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.61 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  37.27 
 
 
254 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  27.35 
 
 
252 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 
277 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  31.28 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  28.88 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  30.5 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  35.64 
 
 
119 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  29.79 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  29.79 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  29.2 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  33.79 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  37.23 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  29.94 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  23.59 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  26.53 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.33 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  30.73 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.64 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 
288 aa  58.9  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.05 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 
742 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.91 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.91 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  28.09 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 
344 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  25.36 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  38.14 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 
333 aa  48.5  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  29.2 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.78 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  34.41 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  27.38 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  26.43 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  30.39 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 
261 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.84 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 
357 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  22.06 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  27.44 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  35.59 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 
354 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  30.14 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  24.69 
 
 
354 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 
262 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 
357 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  20.66 
 
 
373 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>