49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3503 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 324 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  38.39 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  39.82 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 341 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  37.05 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  32.87 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  35.49 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  34.63 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  35.42 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  31.64 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  29.15 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  27.79 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  27.96 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 236 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  29.28 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  34.17 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.23 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  34.93 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  24.67 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  24.62 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  21.15 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  25.56 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  20.57 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  24.25 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  43.86 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  31.9 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  37.88 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>