53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4452 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 385 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 339 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  32.72 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.38 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  26.93 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  27.21 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  27.96 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.81 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  29.63 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  29.52 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  27.78 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  27.57 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  37.65 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  26.54 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  24.19 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  25.61 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 123 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1881  LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 118 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  38 
 
 		 878 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.21 
 
 		 887 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 112 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  31.58 
 
 		 206 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>