43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4574 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 328 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  38.2 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  39.88 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  36.64 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  40.25 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  36.42 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  33.86 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  34.57 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  33.44 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  31.18 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  31.74 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  31.55 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  29.02 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  30.09 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.76 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  27.92 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  29.12 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.66 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  44.94 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 211 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  21.46 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 246 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 142 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>