26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3104 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 142 aa  270  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  52.9 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  49.21 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  62.5 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  53.12 
 
 		 321 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  43.94 
 
 		 324 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  60.47 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  50 
 
 		 332 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  55.32 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 365 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 328 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 477 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 385 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  54.35 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  52.27 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  34.62 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.06 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 337 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>