38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6752 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 328 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  34.5 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  33.14 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  31.06 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  30.26 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  36.36 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.62 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  39.33 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 341 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  30.2 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  36.75 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 323 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 337 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 128 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  34.21 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 112 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  36.26 
 
 		 326 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  54.35 
 
 		 142 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>