32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4211 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  34.35 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.36 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  35.48 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 		 335 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.5 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  32.48 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  33.6 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  37.08 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  42 
 
 		 919 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>