164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7639 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 314 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  44.87 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  40.37 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  36.5 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  37.09 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  33.83 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  34.14 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  29.61 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  33.02 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  30.51 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.88 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  31.02 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  38.37 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  31.04 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  29.38 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  29.97 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.16 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  36.03 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  35.26 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  54.69 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  36.97 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  28.39 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  34.04 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 216 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 882 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 213 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 188 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  31.15 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5376  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 217 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 178 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 508 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 178 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  37.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  44.07 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 954 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0370  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.58 
 
 		 1006 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 500 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>