More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0351 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3573  transcriptional regulator, LuxR family  49.45 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10197  LuxR family two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1891  transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00164243  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0350  LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204823  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2255  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0543436  hitchhiker  0.000519578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5376  transcriptional regulator, LuxR family  38.13 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2930  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4395  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  39.86 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4852  LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.35 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  35.11 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  51.52 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  27.65 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  32.85 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.22 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  30.47 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  31.39 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.12 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.01 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  33.88 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3574  transcriptional regulator, LuxR family  44.58 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  34.53 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.21 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  28.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  28.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  35.06 
 
 		 947 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  28.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  28.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>