More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3574 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3574  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0350  LuxR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 202 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204823  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5376  transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1891  transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00164243  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2255  transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0543436  hitchhiker  0.000519578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4852  LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2930  transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3808  LuxR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 268 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706178  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10197  LuxR family two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4395  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2886  transcriptional regulator, LuxR family  40.25 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197544  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  41.95 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  34.42 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.35 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  34.63 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3573  transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  40.54 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  31.37 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.3 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  34.25 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.48 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.06 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  27.78 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.36 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  36.72 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  27.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  27.31 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0080  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.16 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>