More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1891 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1891  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00164243  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  68.63 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2255  transcriptional regulator, LuxR family  64.22 
 
 		 207 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0543436  hitchhiker  0.000519578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5376  transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4852  LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2930  transcriptional regulator, LuxR family  47.8 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3808  LuxR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706178  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0350  LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204823  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4395  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3574  transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10197  LuxR family two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2886  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197544  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4158  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3573  transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.21 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  35.62 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.3 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  35.02 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  35.92 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  38.62 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.35 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  31.85 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  35.33 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>