53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6990 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 339 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  28.34 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  27.3 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  25.89 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  27.69 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.42 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  24.67 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  30.82 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  26.1 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.17 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  28 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  28.03 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  26.81 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 118 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 208 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 208 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 228 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 112 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  34.55 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3421  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 191 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 208 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>