54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3448 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  37.13 
 
 		 324 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  42.14 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  33.74 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  33.53 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  42.07 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.06 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  35.36 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  33.54 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.77 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  43.88 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  32.67 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  30.92 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  37.76 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 112 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 142 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 477 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  30.89 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  30.94 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 486 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 510 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  51.06 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.03 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 514 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0876088  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 510 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 250 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>