48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2880 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4988  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3421  LuxR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.864452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4481  transcriptional regulator, LuxR family  78.69 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  49.18 
 
 		 321 aa  53.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  36.36 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 768 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 471 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 246 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3907  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  32.79 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 586 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 554 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 454 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  32.79 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4419  competence protein A  41.07 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.610555  normal  0.653302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.79 
 
 		 900 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 281 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 213 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 		 210 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 539 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.18 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  27.45 
 
 		 496 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4301  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 261 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 224 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 226 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 250 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>