109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2275 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  62.92 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  61.8 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  58.78 
 
 		 267 aa  309  4e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  46.39 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  36.09 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  37.64 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  29.32 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  31.23 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  27.9 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  38.13 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  25.09 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  30.9 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  33.79 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.48 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  30.73 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  34.27 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  43.84 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.61 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.61 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  29.61 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27.61 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  38.83 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  28.29 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  35.07 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  28.37 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  29.38 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  30.35 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  26.99 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  27.66 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  27.66 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  30.9 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  25.95 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  41.49 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  25.88 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  32.42 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  32.8 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  23.16 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  24.11 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  45.61 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  38.46 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  37.33 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.9 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  39.71 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  31.64 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  28.57 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  23.68 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  28.9 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  26.7 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  22.69 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  22.69 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  23.68 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  24.25 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>