85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3605 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  28.62 
 
 		 269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  28.29 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  26.95 
 
 		 269 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.93 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.78 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  27.57 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  26.38 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  26.38 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  25.63 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  27.35 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  25.32 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  27.81 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.3 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.94 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  28.29 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  25.97 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  25.48 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  27.81 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  26.67 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.32 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  28.14 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  22.8 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  29.59 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  35.53 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  27.67 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  21.47 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.3 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  23.23 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.16 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  25.15 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  24.37 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  23.46 
 
 		 247 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  26.25 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.39 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  23.12 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 273 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>