59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0705 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  17.5 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  20.08 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  24.12 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  21.77 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  32.94 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  16.45 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  23.27 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  20.16 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.45 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  22.38 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  25.22 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  25.34 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  23.73 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.23 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  18.8 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  23.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.83 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  21.94 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  24.49 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  26.6 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  28.28 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  21.43 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  21.34 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.83 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  24.47 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  25.22 
 
 		 354 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  23.26 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  21.94 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  30.99 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  23.94 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  20.14 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  22.61 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>