114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1597 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  95.68 
 
 
278 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  95.68 
 
 
278 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  95.68 
 
 
278 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  95.68 
 
 
278 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  95.32 
 
 
278 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  95.32 
 
 
278 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  95.68 
 
 
278 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  94.96 
 
 
278 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  94.96 
 
 
278 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  58.05 
 
 
269 aa  345  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  33.83 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  33.2 
 
 
269 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 
272 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 
272 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.51 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  27.47 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  29.2 
 
 
261 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  31.23 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  29.2 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  29.6 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  29.2 
 
 
261 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.13 
 
 
261 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.95 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  28.8 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  28.8 
 
 
261 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.34 
 
 
260 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  30.13 
 
 
252 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 
252 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.19 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  29.71 
 
 
252 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  28.29 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  29.21 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  28.87 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  27.85 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  28.45 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  27.45 
 
 
258 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  27.2 
 
 
224 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  28.03 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  22.63 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  27.85 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  22.91 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  28.88 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  23.2 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  40.91 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.83 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  22.34 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  37.11 
 
 
119 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  21.21 
 
 
350 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  32.11 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.22 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  24.56 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  26.76 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  31.96 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  26.39 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 
355 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  42.62 
 
 
223 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  32 
 
 
283 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  26.26 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 
344 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  25.17 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  21.31 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.22 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 
281 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>