71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1982 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  27.45 
 
 
278 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  26.19 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  26.1 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  26.75 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  26.1 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  26.1 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  22.56 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.29 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  26 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 
261 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  24.08 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  24.12 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  26.34 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  24.37 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  31.29 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 
742 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  22.09 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  32.32 
 
 
119 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  20.65 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  20.65 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  22.45 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.02 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  22.95 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 
358 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  22.54 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  22.95 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.22 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  22.22 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  26.25 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  22.62 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  21.83 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  22.8 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  21.83 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  20.4 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  22.63 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.56 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  24.65 
 
 
363 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  19.5 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  26.45 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  23.85 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  25.74 
 
 
352 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  22.96 
 
 
252 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  21.01 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  22.96 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  21.25 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  23.05 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  23.05 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  23.05 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  23.05 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  24.62 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  29.66 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  22.66 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.21 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  26.95 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  26.51 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>