101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6913 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  93.7 
 
 
272 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  93.7 
 
 
272 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  74.73 
 
 
277 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  29.24 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.73 
 
 
269 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  32.41 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
269 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 
261 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  33.13 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  30.82 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  27.44 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  28.05 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  31.45 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27.44 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  28.05 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  27.44 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27.44 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  30.82 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.83 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.44 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  33.19 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.99 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  32.7 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  32.7 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  32.7 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  32.7 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  32.7 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  33.13 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  33.13 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.37 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  33.12 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.95 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  35.05 
 
 
119 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  26.75 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  34.78 
 
 
386 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  26.81 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  29.8 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.14 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  34.25 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  30.9 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  20.4 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  21.89 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  28.75 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  25.36 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  22.59 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.08 
 
 
358 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 
255 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.9 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  30.38 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 
350 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 
267 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  31.65 
 
 
357 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  30.77 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  30.4 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  31.96 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  25.85 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  27.81 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>