41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0992 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 211 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  28.99 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  26.1 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  26.1 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.1 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  25.91 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  27.65 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.65 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.65 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27.19 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  22.45 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  21.77 
 
 		 344 aa  48.5  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  26.28 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  25.19 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  17.61 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  20.97 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.7 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  21.38 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  31.15 
 
 		 125 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.15 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 223 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  29.55 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  23.85 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>