74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2646 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 352 aa  696    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  80 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  55.43 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  48.15 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  49.01 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  35.77 
 
 		 357 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  35.54 
 
 		 247 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  29.36 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  32.8 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  26.58 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  25.35 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 742 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  23.55 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  30.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  36.04 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  32.72 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  23.14 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  24.66 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  33.1 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  24.69 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  26.17 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.31 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  27.91 
 
 		 273 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.39 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  20.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  20.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  21.33 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.39 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  24.57 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.58 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  21.79 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.94 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  20.87 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.39 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  21.79 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.39 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  21.79 
 
 		 261 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  21.79 
 
 		 261 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  21 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22.94 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.39 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  23.95 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.39 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  24.39 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  25.57 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  27.08 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.89 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  19.23 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  23.7 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>