71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4842 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
252 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  94.44 
 
 
252 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  94.05 
 
 
252 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  93.25 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  93.65 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  93.25 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  93.25 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  93.25 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  92.46 
 
 
252 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  92.86 
 
 
252 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  86.51 
 
 
252 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  29.75 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  28.28 
 
 
261 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  29.75 
 
 
261 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 
261 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.87 
 
 
261 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  27.92 
 
 
261 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.72 
 
 
278 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 
278 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  29.34 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  29.34 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  29.32 
 
 
278 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  29.34 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  29.29 
 
 
278 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  29.32 
 
 
278 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.87 
 
 
278 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.27 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  25.63 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  25.54 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  25.54 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.82 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  24.9 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  28.93 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.38 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  26.9 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  22.13 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  22.48 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  23.24 
 
 
345 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  19.91 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  22.81 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
271 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  19.91 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  32.32 
 
 
119 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  35 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 
357 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  27.21 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  21.93 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  21.85 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  31.46 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  23.31 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  22.81 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  22.37 
 
 
344 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  26.83 
 
 
269 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 
263 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>