67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0272 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  34.56 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  23.35 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  23.13 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  27.44 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.22 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  25.68 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.32 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  23.84 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  27.8 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  34.21 
 
 		 119 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  24.11 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  24.73 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  26.21 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  25.14 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.65 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  24.09 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  25.44 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.44 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 		 250 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  23.89 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  31.34 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  23.34 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  23.57 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  22.7 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  25 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  21.64 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  27.89 
 
 		 262 aa  45.8  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  40 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  24.43 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  28.04 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  22.97 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  23.02 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  25.77 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  21.81 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.53 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  24.24 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  24.24 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  24.24 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  24.24 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  24.24 
 
 		 252 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>