50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1188 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 353 aa  722    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  23.88 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  28.99 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  23.55 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  23.56 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  24.63 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  21.49 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  22.28 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  21.82 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  24.87 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  23.86 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.24 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  31.68 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  21.88 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  25.58 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  22.25 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  34.85 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  21.07 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 250 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.96 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  22.9 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 269 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>